科学家发现16种新冠突变毒株,去年已传播

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  昨日,《自然·医学》发表的一篇论文对南非新冠肺炎大流行前6个月中分离得到的1300多个新冠病毒近全基因组进行了分析,发现了16个新的病毒变异体。其中3个变异体在南非的第一波疫情中广泛传播,引发了当时南非全国约42%的感染。新发现的C系变种C.1则是截至2020年8月底在南非地理分布最广泛的种类。

  撰文丨杨心舟

  南非在去年3月5日报告了首例新冠病毒感染病例,仅隔了不到半个月,南非就宣布了封城措施,尽管从当时的反应来看,南非的应对措施算得上迅速,但截至去年11月,南非的累计确诊人数已经超过了78.5万。为了找到前期南非新冠病毒的传播演化途径,南非夸祖鲁-纳塔尔大学的研究人员再次回溯分析了南非实验室基因监测网络(Network  Genomic Surveillence)中上传的基因序列。

  而南非最近引起关注的突变体501.V2也是基于这个监测网络分析得到的。目前,官方认为,501.V2突变体在南非第二波疫情中占据了主导地位,科学界对该突变体的出现都表示出担忧,原因在于其会引起免疫逃逸,从而可能降低疫苗有效性。

  但实际上,南非第一波疫情可能更加复杂,《自然·医学》的新研究报告了南非在第二波疫情之前出现过的一系列突变体,在去年3月至8月间的近全基因组分析中,一共有16种新的突变体浮出水面。其中三种突变体B.1.1.54、B.1.1.54和C.1在第一波疫情中传播广泛,引发了当时南非约42%的感染。按照当下新冠病毒的系统谱系,谱系A主要指的是在亚洲流行,传播至其他地区的病毒分支,而谱系B则是主要在欧洲地区流行,并传播到其他地区的病毒分支。而此次南非发现的谱系C,则被认为是从B.1.1.1演化而来,并在南非特异性传播的变异体。

   红框中为南非发现的新变异体。图片来源论文。 

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